MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL04

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014827	ATA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133711
2	NC_014827	CTT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133711
3	NC_014827	A	7	7	135	141	100 %	0 %	0 %	0 %	317133711
4	NC_014827	AGA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133711
5	NC_014827	AT	3	6	219	224	50 %	50 %	0 %	0 %	317133711
6	NC_014827	GTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133711
7	NC_014827	A	6	6	294	299	100 %	0 %	0 %	0 %	317133711
8	NC_014827	GCAGA	2	10	393	402	40 %	0 %	40 %	20 %	317133712
9	NC_014827	GAT	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133712
10	NC_014827	AAGC	2	8	545	552	50 %	0 %	25 %	25 %	317133712
11	NC_014827	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	317133712
12	NC_014827	TAA	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133712
13	NC_014827	ATT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133713
14	NC_014827	TCAT	2	8	732	739	25 %	50 %	0 %	25 %	317133713
15	NC_014827	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133713
16	NC_014827	CAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133713
17	NC_014827	CT	3	6	818	823	0 %	50 %	0 %	50 %	317133713
18	NC_014827	ACCGC	2	10	840	849	20 %	0 %	20 %	60 %	317133713
19	NC_014827	T	7	7	875	881	0 %	100 %	0 %	0 %	317133713
20	NC_014827	CAGCT	2	10	950	959	20 %	20 %	20 %	40 %	317133713
21	NC_014827	TTC	2	6	965	970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133713
22	NC_014827	TGTA	2	8	1099	1106	25 %	50 %	25 %	0 %	317133714
23	NC_014827	TC	3	6	1110	1115	0 %	50 %	0 %	50 %	317133714
24	NC_014827	ATA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133714
25	NC_014827	CTT	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
26	NC_014827	TTC	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
27	NC_014827	GT	3	6	1228	1233	0 %	50 %	50 %	0 %	317133714
28	NC_014827	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
29	NC_014827	TTA	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
30	NC_014827	ATAA	2	8	1314	1321	75 %	25 %	0 %	0 %	317133714
31	NC_014827	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133714
32	NC_014827	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133715
33	NC_014827	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133715
34	NC_014827	GCA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
35	NC_014827	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
36	NC_014827	TGA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
37	NC_014827	GCA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
38	NC_014827	CGG	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133715
39	NC_014827	GCTAT	2	10	4859	4868	20 %	40 %	20 %	20 %	317133715
40	NC_014827	CCGT	2	8	4896	4903	0 %	25 %	25 %	50 %	317133715
41	NC_014827	GTT	3	9	4966	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133715
42	NC_014827	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
43	NC_014827	AAG	3	9	5017	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133715
44	NC_014827	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
45	NC_014827	A	6	6	5146	5151	100 %	0 %	0 %	0 %	317133715
46	NC_014827	GAT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
47	NC_014827	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133715
48	NC_014827	TAA	2	6	5319	5324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133715
49	NC_014827	AGC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
50	NC_014827	GCA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
51	NC_014827	TGG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
52	NC_014827	A	6	6	5622	5627	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
53	NC_014827	GTGG	2	8	5635	5642	0 %	25 %	75 %	0 %	317133716
54	NC_014827	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
55	NC_014827	GAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
56	NC_014827	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
57	NC_014827	ATG	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133716
58	NC_014827	ATA	2	6	5950	5955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133716
59	NC_014827	A	6	6	5955	5960	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
60	NC_014827	TTA	2	6	5961	5966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133716
61	NC_014827	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
62	NC_014827	AGC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
63	NC_014827	TGG	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133716
64	NC_014827	CCGA	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	317133716
65	NC_014827	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	317133717
66	NC_014827	GAA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133717
67	NC_014827	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133717
68	NC_014827	TGG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133717
69	NC_014827	A	6	6	6236	6241	100 %	0 %	0 %	0 %	317133717
70	NC_014827	AGCCTG	2	12	6255	6266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317133717
71	NC_014827	AT	3	6	6300	6305	50 %	50 %	0 %	0 %	317133717
72	NC_014827	AGG	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133717
73	NC_014827	GAA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133718
74	NC_014827	TCT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
75	NC_014827	TC	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	317133718
76	NC_014827	ACA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133718
77	NC_014827	GCCTT	2	10	6543	6552	0 %	40 %	20 %	40 %	317133718
78	NC_014827	GCT	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133718
79	NC_014827	ATG	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133718
80	NC_014827	AGC	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133718
81	NC_014827	TAC	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718
82	NC_014827	TCT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
83	NC_014827	TAC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718
84	NC_014827	TGAAT	2	10	6706	6715	40 %	40 %	20 %	0 %	317133718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.